答案或建议：

不能抵扣进项税额，

增值税暂行条例：
第十条　下列项目的进项税额不得从销项税额中抵扣：
　　（一）用于非增值税应税项目、免征增值税项目、集体福利或者个人消费的购进货物或者应税劳务；

暂行条例实施细则：
第二十一条 条例第十条第（一）项所称购进货物，不包括既用于增值税应税项目（不含免征增值税项目）也用于非增值税应税项目、免征增值税（以下简称免税）项目、集体福利或者个人消费的固定资产。
　　前款所称固定资产，是指使用期限超过12个月的机器、机械、运输工具以及其他与生产经营有关的设备、工具、器具等。

由此可见，公司所购客车仅用于员工上下班，属于用于集体福利购进，是不能抵扣进项税的